Под тиреоидной пероксидазой подразумевают фермент, который относится к гликопротеиновой природе. Данный микросомальный антиген принимает участие в процессе синтеза тиреоидных гормонов. Аутоиммунный процесс включает в себя антитела к тиреопероксидазе, которые вырабатываются к тканям, входящие в состав щитовидной железы. Когда происходит расстройство работы тиреоидной функции, то это зачастую связывается с аутоиммунным процессом. При этом большая доля процента значения отводится именно для антител к тиреопероксидазе. Самая высокая концентрация выявляется при возникновении тиреоидита Хашимото. При наступлении последнего этапа атрофии щитовидной железы, начинает ускоренно понижаться уровень антител. Очень часто подобные антитела к тиреопероксидазе проявляются как признак присутствия базедовой болезни. Если их выявление продолжается достаточно длительное время, то это знак для последующего формирования гипотиреоза. У женщин антитела могут вырабатываться в процессе беременности. Однако это может указывать и на присутствие болезни разных видов. К ним чаще всего относят аденомы, зоб, раковые опухоли щитовидной железы.